عارف کامل مرحوم علّامه طهرانی رحمة الله علیه می فرمودند: مرحوم شهید آیت الله حاج شیخ محمّد صدوقی رحمة الله علیه سومین شهید محراب، مرد شریف و خوبی بود؛ که (قبل از انقلاب هم) خیلى فعالیّت مى کرد و کارهایشان خیلى خوب بود.
می فرمودند: ما وقتى که لمعه مى خوانیدیم، مى رفتیم درس آقاى صدوقی؛ ما خیلى اشکال مىکردیم. یک روز آقاى صدوقى ما را صدا کرد گفت فلانى ببین صاف دارم به تو میگویم این درس به درد تو نمیخورد تو باید بروى یک استاد خصوصى پیدا کنى این اشکالاتى که تو مى کنى مال این درس نیست ما هم دیگر نرفتیم و درس دیگرى رفتیم.
می فرمودند: مرحوم شهید صدوقی به من نظر خاصّى داشتند و پیوسته با این نظر با ما مواجه بودند. یک روز آمد حجره ما و گفت: من امروز فقط آمده ام این را به تو بگویم که جنابعالى مجبورى و موظّفى و خلاصه متعهّدى از طرف پروردگار که به نجف بروى و حدّاقل شش سال طهران نیائى که بالاخره ما هم مشرّف شدیم به نجف اشرف و در نجف اشرف هم مجموع ماندمان 7 سال شد. منبع: از خلال مکتوبات و فرمایشات علّامه طهرانی ره
*مرحوم آیت الله حاج شیخ محمد صدوقی یزدی در روز 11 تیر 1361 مطابق با 10 ماه مبارک رمضان سال 1402 قمری، پس از ادای نماز جمعه در حالی که جایگاه را ترک میکرد توسط منافقین به فیض رفیع شهادت دست پیدا کرد.